subtomograms as stack or each subtomogram as .mrc?

[albertmena]

Las tilt series con las imagenes 2D acquiridas en el microscopio, fruto de inclinar la muesta a distintos ángulos. Con laa tilt series se obtiene el tomograma (representacion 3d de la muestra). En el tomograma hay proteinas que hay que selecionar y picar, estas proteinas son los subtonmogramas. Pero como el tomograma ya es una reconstrucción, es decir un objeto 3d, los subtomogramas tambien lo son. Son volumenes que luego se tratan
en el subtomogram averagin se calcula el promedio de los subtomograma para ver la estructura de la proteina.
Así como números en función del downsampling los tomogramas ocupan entre 1Gb-100Gb se trabaja con unos 100 tomogramas. El numero de subtomogramas va de 5000-200000, y cada uno puede pesar desde unas pocas menoas hasta 100-300Mb. Como puedes ver el volumen de datos puede ser considerable

[albertmena]

each subtomogram as .mrc !!