-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 3
/
main.py
executable file
·135 lines (111 loc) · 5.12 KB
/
main.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
r"""
Program na priraďovanie hospitalizačných prípadov do medicínskych služieb.
Vytvorí kópiu vstupného súboru s pripojeným novým stĺpcom so zoznamom priradených medicínskych služieb.
Args:
file_path: Relatívna cesta k súboru s dátami.
--vsetky_vykony_hlavne, -v: Pri vyhodnotení príloh predpokladaj, že ktorýkoľvek z výkazaných výkonov mohol byť hlavný.
--vyhodnot_neuplne_pripady, -n: V prípade, že nie je vyplnená nejaká povinná hodnota, aj tak pokračuj vo vyhodnocovaní. Štandardne vráti hodnotu 'ERROR'.
--ponechaj_duplicity, -d: Vo výstupnom zozname medicínskych služieb ponechaj aj duplicitné záznamy.
Returns:
None
Examples:
# Spustenie na Linuxe
python3 ./main.py ./test_data.csv
# Spustenie so zapnutým prepínačom na vyhodnotenie aj neúplných prípadov
python3 ./main.py ./test_data.csv --vyhodnot_neuplne_pripady
# Spustenie so všetkými prepínačmi zapnutými
python3 ./main.py ./test_data.csv -vnd
# Spustenie na Windows
python .\main.py .\test_data_phsk_2.csv -vnd
"""
import argparse
from copy import deepcopy
from grouper.priprava_dat import (
priprav_hp,
validuj_hp,
priprav_citac_dat,
priprav_zapisovac_dat,
)
from grouper.vyhodnotenie_priloh import prirad_ms
def grouper_ms(
file_path,
vsetky_vykony_hlavne=False,
vyhodnot_neuplne_pripady=False,
ponechaj_duplicity=False,
):
"""
Funkcia na priraďovanie hospitalizačných prípadov do medicínskych služieb.
Vytvorí kópiu vstupného súboru s pripojeným novým stĺpcom so zoznamom priradených medicínskych služieb.
Args:
file_path (str): Relatívna cesta k súboru s dátami.
vsetky_vykony_hlavne (bool, optional): Pri vyhodnotení príloh predpokladaj, že ktorýkoľvek z výkazaných výkonov mohol byť hlavný.
vyhodnot_neuplne_pripady (bool, optional): V prípade, že nie je vyplnená nejaká povinná hodnota, aj tak pokračuj vo vyhodnocovaní. Štandardne vráti hodnotu 'ERROR'.
ponechaj_duplicity (bool, optional): Vo výstupnom zozname medicínskych služieb ponechaj aj duplicitné záznamy.
Returns:
None
"""
if vsetky_vykony_hlavne:
print(
"Aktivovaný prepínač 'Všetky výkony hlavné'. Pri vyhodnotení príloh sa bude predpokladať, že ktorýkoľvek z výkazaných výkonov mohol byť hlavný."
)
if vyhodnot_neuplne_pripady:
print(
"Aktivovaný prepínač 'Vyhodnoť neúplné prípady'. V prípade, že nie je vyplnená nejaká povinná hodnota, aj tak sa bude pokračovať vo vyhodnocovaní."
)
if ponechaj_duplicity:
print(
"Aktivovaný prepínač 'Ponechaj duplicity'. Vo výstupnom zozname medicínskych služieb budú ponechané aj duplicitné záznamy."
)
with open(file_path, "r", encoding="utf-8") as input_file:
with open(
f"{file_path[:-4]}_output.csv", "w", encoding="utf-8", newline=""
) as output_file:
reader = priprav_citac_dat(input_file)
writer = priprav_zapisovac_dat(output_file)
writer.writeheader()
for hospitalizacny_pripad in reader:
hp = deepcopy(hospitalizacny_pripad)
if not validuj_hp(hp, vyhodnot_neuplne_pripady):
hospitalizacny_pripad["ms"] = "ERROR"
writer.writerow(hospitalizacny_pripad)
continue
priprav_hp(hp)
medicinske_sluzby = prirad_ms(hp, vsetky_vykony_hlavne)
if not ponechaj_duplicity:
# deduplikuj medicinske sluzby
medicinske_sluzby = list(dict.fromkeys(medicinske_sluzby))
hospitalizacny_pripad["ms"] = "~".join(medicinske_sluzby)
writer.writerow(hospitalizacny_pripad)
if __name__ == "__main__":
# Nastav argumenty pri spúšťaní
parser = argparse.ArgumentParser(
description="Funkcia na priraďovanie hospitalizačných prípadov do medicínskych služieb."
)
parser.add_argument(
"data_path", action="store", help="Relatívna cesta k súboru s dátami."
)
parser.add_argument(
"--vsetky_vykony_hlavne",
"-v",
action="store_true",
help="Pri vyhodnotení príloh predpokladaj, že ktorýkoľvek z vykázaných výkonov mohol byť hlavný. Štandardne sa za hlavný výkon považuje iba prvý vykázaný, prípadne žiaden, pokiaľ zoznam začína znakom '~'.",
)
parser.add_argument(
"--vyhodnot_neuplne_pripady",
"-n",
action="store_true",
help="V prípade, že nie je vyplnená nejaká povinná hodnota, aj tak pokračuj vo vyhodnocovaní. Štandardne vráti hodnotu 'ERROR'.",
)
parser.add_argument(
"--ponechaj_duplicity",
"-d",
action="store_true",
help="Vo výstupnom zozname medicínskych služieb ponechaj aj duplicitné záznamy.",
)
args = parser.parse_args()
grouper_ms(
args.data_path,
args.vsetky_vykony_hlavne,
args.vyhodnot_neuplne_pripady,
args.ponechaj_duplicity,
)