-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
compShader2.comp
372 lines (330 loc) · 15.5 KB
/
compShader2.comp
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
#version 430
// #extension GL_ARB_shading_language_include : enable
#define BLOCK_SIZE_X 1 // butina del find-replace in shader.cpp
#define BLOCK_SIZE_Y 1 //
layout(local_size_x = BLOCK_SIZE_X, local_size_y = BLOCK_SIZE_Y) in;
layout(binding = 3, std430) buffer b1 {
float u_[];
}; // 1,2,3 bufferiai jau paskirti
layout(binding = 4, std430) buffer b2 { float v_[]; };
layout(binding = 5, std430) buffer b3 { float w_[]; };
layout(binding = 6, std430) buffer b4 { float J_ion[]; };
layout(binding = 7, std430) buffer b5 { float J_gj[]; };
layout(binding = 9, std430) buffer buff_u_reg { float u_reg[]; };
layout(binding = 15, std430) buffer b_dbg {
float dbg[16];
}; // size for testing
// layout(binding = 10, std430) buffer b6 {float gj[];}; //W,NW,NE
layout(location = 20) uniform ivec2 size; // XY
layout(location = 21) uniform float dt_sim;
layout(location = 22) uniform uint i;
layout(location = 25) uniform uint i_frame_in_current_chunk; // iteration
layout(location = 23) uniform bool mouse_pressed;
layout(location = 24) uniform uvec2 mouse_coords;
// uint adr = gl_GlobalInvocationID.y*size.x+gl_GlobalInvocationID.x;
uint x = gl_GlobalInvocationID.x;
uint y = gl_GlobalInvocationID.y;
uint adr = y * size.x + x;
// keisti nereikia, (padidinus local, reikia sumazinti glDispatchCompute,
// gl_GlobalInvocationID.x pasikeicia automatiskai trink:
// uint x = gl_GlobalInvocationID.x * gl_WorkGroupSize.x +
// gl_LocalInvocationID.x; uint y = gl_GlobalInvocationID.y * gl_WorkGroupSize.y
// + gl_LocalInvocationID.y;
//# include mc4sm.comp
float rand(vec2 co) { // bandymams, trink
return fract(sin(dot(co.xy, vec2(12.9898, 78.233))) * 43758.5453);
}
float normToVolt(float u_norm) {
const float Vfi = 15e-3; // nernst potential of fast gate
const float V0 = -85e-3;
return (u_norm * (Vfi-V0) + V0) * 1.0e3;
}
void main() {
// u_[gl_GlobalInvocationID.y*size.x+gl_GlobalInvocationID.x] =
//
// gl_GlobalInvocationID.x /64.f; //
// gl_LocalInvocationID.x/16.f;//float(gl_GlobalInvocationID.x)
/// (gl_NumWorkGroups.x);
if (x >= 0 && x < size.x && y >= 0 && y < size.y) {
// if (x > 0 && x < size.x-1 && y > 0 && y < size.y-1 ) {
// float C = 1.f; //#microF/cm2
// float Area = 8.8e-5;// #cm2
// float u = u_[adr];
float I_ext = 0;
int first = 1; // t first impulse on, ms
float pulse_width = 2; //ms
// float pulse1 = 60*4.f;// BPM // CV meas
float pulse1 = 60.f;// BPM
float pulse2 = 75.f;// BPM
float pulse3 = 90.f;// BPM
float pulse4 = 105.f;// BPM
float pulse5 = 120.f;// BPM
float pulse6 = 135.f;// BPM
float pulse7 = 150.f;// BPM
float pulse8 = 165.f;// BPM
float pulse9 = 180.f;// BPM
float pulse10 = 240.f;// BPM
float t_switch_to_pulse2 = 40000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse3 = 80000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse4 = 120000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse5 = 160000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse6 = 200000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse7 = 240000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse8 = 280000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse9 = 320000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
float t_switch_to_pulse10 = 360000.f;// nuo kada pradeti pulse2, ms
const float minute_ms = 60000.f; // kiek ms vienoje minuteje
float pulse_period = minute_ms / pulse1; // ms
float t = float(i)*dt_sim;
if ( t > t_switch_to_pulse2) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse2; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse3) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse3; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse4) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse4; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse5) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse5; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse6) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse6; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse7) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse7; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse8) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse8; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse9) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse9; // ms
if ( t > t_switch_to_pulse10) // pulso daznio keitimas po tam tikro laiko, ms
pulse_period = minute_ms/pulse10; // ms
// int second = 250; // ms
// while (true) {
// }
// float pulse_period_i = pulse_period * 1./dt_sim; // pulso periodas iteracijom
pulse_period = minute_ms/pulse5; // ms
I_ext = //( (i*dt_sim > first && i*dt_sim < first+2)
//|| (i*dt_sim > first+delay && i*dt_sim < first+delay + 1) ) &&
// ((i >= first * 1./dt && i <= (first + pulse_width) * 1./dt) || // kai naudojamas pulse1
( i % int(pulse_period/dt_sim) >= 0 && i % int(pulse_period/dt_sim) <= int(pulse_width/dt_sim) )
// ( i % (50*100) > 0 && i % (50*100) < 50*2 )
// ||
// (i >= second * 50 &&
// i <= (second + 2) * 50)) // periodinis stim. 100it(2ms)
// ilgio
//&& (y >= 64-5 && y <= 64+5 && x >= 64-4 &&
// x <= 64+4) //? .25f : 0;
// && (pow(int(y) - 10-1, 2) + pow(int(x) - 4 + 5, 2) <= 5) // zad. apvali zona kaireje apacioje
// && (pow(int(y) - 32, 2) + pow(int(x) - (32-10), 2) <= 3*3) // zad. apvali zona
// && (x == 5) && ( abs(y) >= 200) // zad. plokscia banga
&& (x >= 0) && (x < 5) // zad. plokscia banga
? .2f
: 0;
// I_ext = 0;
// if (t >= 10 && t <= 12)
// if (x >= 10 && x < 12) // zad. plokscia banga
// I_ext = .2f;
// if (t >= 550 && t <= 555) // test
// if (t >= 540 && t <= 545) // drift
// if (t >= 615 && t <= 620) // drift
// if (t >= 620 && t <= 625) // drift
// if (t >= 550 && t <= 555) // veikia, vienas reentry
// if (t >= 500 && t <= 505) // 300 laidumas, visos laidzios
// if (t >= 660 && t <= 665) // 100 laidumas su orig
// if (t >= 475 && t <= 470) // veikia kai visos laidzios
// if (t >= 455 && t <= 460) // veikia kai 25proc neleidziu
// if (x >= 240 && x < 255 && y > 100) // zad. plokscia banga - parallel-field
// if (x >= 240 && x < 255 && y < 160) // zad. plokscia banga - parallel-field - drift
// // if (x > 0 && x < 2) // zad. plokscia banga - nuo x=0
// // if (y >= 0 && y < 150 && x <= 500) // zad. plokscia banga - cross-field (Nayak 2013 https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0072950)
// I_ext = .2f;
// fibril. bandymai: su init excit.
// I_ext = 0.f;
// if ( (t >= 0 && t <= 5) || (t >= 100 && t < 105) )
// if (x >= 320 && x < 330 && y > 140)
// I_ext = .2f;
// // fibril. bandymai: s1s2 init
// I_ext = 0.f;
// if ( t >= 0 && t <= 2 )
// if (x > 0 && x < 5)
// I_ext = .2f;
// if ( t >= 625 && t <= 627 )
// if (x > 320 && x < 330 && y > 140 )
// I_ext = .2f;
// // s1s2, gaunas reentry VCT sugeneruotam klasteryje (477)
// I_ext = 0.f;
// if ( t >= 0 && t <= 2 )
// if (x > 0 && x < 5)
// I_ext = .2f;
// if ( t >= 705 && t <= 707 ) //if ( t >= 625 && t <= 627 )
// if (x > 380 && x < 400 && y > 80 ) // y 130
// I_ext = .2f;
// // // // s1s2, 10 imgs
// I_ext = 0.f;
// if ( t >= 50 && t <= 55 )
// if (x > 0 && x < 5)
// I_ext = .2f;
// if ( t >= 620 && t <= 625 ) //if ( t >= 580 && t <= 585 )
// if (x > 250 && x < 270 && y > 80 ) // y 130
// I_ext = .2f;
// I_ext = mouse_pressed && (pow(int(x) - int(mouse_coords.x), 2) +
// pow(int(y) - int(mouse_coords.y), 2))
// < 25.
// ? .05f
// : 0;
// I_ext = mouse_pressed && x >= mouse_coords.x-1
// &&x <=
// mouse_coords.x+1 && y >= mouse_coords.y-1 && y <=
// mouse_coords.y+1/*mouse_coords.y == y*/ ? 2.f : 0;
float JgjW = 0;
float JgjNW = 0;
float JgjNE = 0;
float JgjE = 0;
float JgjSE = 0;
float JgjSW = 0;
int xL = int(x) - 1;
int xR = int(x) + 1;
int yD = int(y) - 1; // down
// periodic boundaries checks
if (xL == -1) // periodic boundary left
xL = int(size.x)-1; // take x on right
// xL = 0; // isjungiam
if (xR == int(size.x)) // periodic boundary right
xR = 0;
// int(size.x) - 1; // isjungiam
if (yD == -1) // periodic boundary right
yD = int(size.y) - 1;
// yD = 1; // isjungiam
// // tikrinam ar ne pasienes lasteles, jei taip sroviu i siena neskaiciuojam
// if (x > 0)
// JgjW = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3];
// if (x < int(size.x) - 1)
// JgjE = -J_gj[y * size.x * 3 + xR * 3]; // JgjE = -J_gj[y*size.x*3 + (x+1)*3];
// if (x > 0 && y < int(size.y) - 1)
// JgjNW = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3 + 1];
// if (x < int(size.x) - 1 && y < int(size.y) - 1)
// JgjNE = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3 + 2];
// tikrinam ar ne pasienes lasteles, jei taip sroviu i siena neskaiciuojam
// get W, NW, NE
// if (x > 0) //checkai jau yra compShader1
JgjW = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3];
// if (x > 0 && y < int(size.y) - 1)
JgjNW = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3 + 1];
// if (x < int(size.x) - 1 && y < int(size.y) - 1)
JgjNE = J_gj[y * size.x * 3 + x * 3 + 2];
// get E, SE, SW
JgjE = -J_gj[y * size.x * 3 + xR * 3]; // JgjE = -J_gj[y*size.x*3 + (x+1)*3];
if (y % 2 == 0) {
JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x-1)*3 + 2]; NE
JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + xL * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 1]; //NW
} else { // when y % 2 != 0
JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + xR * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 2];
JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x+1)*3 + 1];
}
bool isPeriodicLR = false; //left-right
bool isPeriodicUD = true; //up-down
if (!isPeriodicLR) {
if (x == 0 && !isPeriodicLR)
JgjW = 0;
if (x == size.x - 1 && !isPeriodicLR)
JgjE = 0;
if ( (y == size.y - 1 && !isPeriodicUD) || (y % 2 == 0 && x == 0 && !isPeriodicLR) )
JgjNW = 0;
if ( (y == size.y - 1 && !isPeriodicUD) || ( y % 2 != 0 && x == size.x - 1 && !isPeriodicLR) )
JgjNE = 0;
if ( (y == 0 && !isPeriodicUD) || (y % 2 == 0 && x == 0 && !isPeriodicLR) )
JgjSW = 0;
if ( (y == 0 && !isPeriodicUD) || (y % 2 != 0 && x == size.x - 1 && !isPeriodicLR) )
JgjSE = 0;
}
// // pries periodic ivedima
// // get E, SE, SW
// if (x < int(size.x) - 1)
// JgjE = -J_gj[y * size.x * 3 + xR * 3]; // JgjE = -J_gj[y*size.x*3 + (x+1)*3];
// if ( y > 0) // <- bottom boundary condition: disconnected J_bottom_*= 0 or commment this line to enable periodic BC
// if (y % 2 == 0) {
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x-1)*3 + 2]; NE
// if (x > 0)
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + (x-1) * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 1]; //NW
// } else { // when y % 2 != 0
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x+1)*3 + 1];
// if (x < size.x - 1)
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 2];
// }
// if ( y > 0 )
// {
// if (y % 2 == 0) {
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + (x-1) * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 1]; //NW
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x-1)*3 + 2]; NE
// } else { // when y % 2 != 0
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 2]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x+1)*3 + 1];
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 2];
// }
// }
// if ( y > 0
// && x > 0
// // && x < size.x - 1 ) //kai down-up ne periodic
// )
// {
// if (y % 2 == 0) {
// if (y > 0)
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 1]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 1]; //NW
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + xL * 3 + 2]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x-1)*3 + 2]; NE
// } else { // when y % 2 != 0
// JgjSW = -J_gj[yD * size.x * 3 + xR * 3 + 1]; // JgjSW = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + (x+1)*3 + 1];
// JgjSE = -J_gj[yD * size.x * 3 + x * 3 + 2]; // JgjSE = -J_gj[(y-1)*size.x*3 + x*3 + 2];
// }
// }
// dbg[y*size.x*2 + x*2] = JgjW;
// pridedam nesuzadinamu last.
//bool isExcitable = rand(vec2(0.123, x * y)) < 0.95f;
// float J = (isExcitable ? J_ion[adr] : 0.0f) + JgjW + JgjE + JgjNW + JgjNE + JgjSE + JgjSW;
float J = J_ion[adr] + JgjW + JgjE + JgjNW + JgjNE + JgjSE + JgjSW;
// float J = JgjW + JgjE + JgjNW + JgjNE + JgjSE + JgjSW;
// u_[adr] = 1e-10*dt_sim * (I_ext + J); //#/(Cm*Area); // WORKS
u_[adr] += dt_sim * (I_ext + J); //#/(Cm*Area); // WORKS
//TODO: cia daro kiekviena i, bet galima tik as i_frame
u_reg[i_frame_in_current_chunk*size.x*size.y + y*size.x + x] = normToVolt(u_[adr]);
// u_[adr] = x == 31 ? 1 : 0;
// int d = 4;
// u_[adr] = x > 32 - d && x < 32 + d && y > 32 - d && y < 32 + d ? 0.5 : 0; //#/(Cm*Area); // WORKS
// u_[adr] = (pow(int(y) - 33-1, 2) + pow(int(x) - 33-1, 2) < 10*10) ? 0.5 : 0; //#/(Cm*Area); // WORKS
// u_[adr] = rand(vec2(i, x * y)); // testams;
// u_[adr] = .5;
// float a[2] = {1.,1.};
// float b[2] = a;//{0,0};
// float tmp = 0;
// b = a;
// a[0] = .5;
// a[1] = .5;
// float a[4 * 4] = {.1, .2, .03, .4, .01, .2, .3, .4,
// .01, .2, .3, .4, .1, .2, .3, .4};
// float b[4 * 4];
// // = { .2, .2,.2,.2,
// // .2, .2,.2,.2,
// // .2, .2,.2,.2,
// // .2, .2,.2,.2};
// b = r8mat_expm1(4, a);
// u_[adr] = b[0];
// dbg = b;
// // dbg[1] = 2;
// // u_[adr] = float(gl_LocalInvocationID.x) / (gl_WorkGroupSize.x);
// float pars[5] = float[](0.1522, 0.0320, 0.2150, -34.2400, 0.2570);
// float gmax = 1.;
// float par[14] = float[](pars[0], pars[1], pars[2], pars[3], -1, 2 * gmax,
// pars[4] * gmax, // % left side
// pars[0], pars[1], pars[2], pars[3], -1, 2 * gmax,
// pars[4] * gmax); // % right side
// float dt = 0.01;
// float T = 100.;
// const int N = 10000;
// float V[N];
// float gj[N];
// float p[4];
// V[0] = 0;
// gj[0] = mc4sm_ss(V[0], par, p);
// for (int i = 0; i < N; i++) {
// V[i] = 100. * (i + 1) * dt / 100.;
// gj[i] = mc4sm(V[i], dt, par, p);
// dbg[i * 3 + 0] = i * dt;
// dbg[i * 3 + 1] = V[i];
// dbg[i * 3 + 2] = gj[i];
// }
}
}