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Klinische Dokumentation für das Netzwerk Seltene Erkrankungen (MV GenomSeq)

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KohlbacherLab/nse-mv-genomseq

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Klinische Dokumentation für das Netzwerk Seltene Erkrankungen (MV GenomSeq)

Projektvorlage für REDCap zur klinischen Dokumentation des Netzwerks Seltene Erkrankungen (NSE).

Installation

Es gibt 2 Varianten des Projekts:

  • Dokumentation mit Daten zum Fallmanagement
  • Dokumentation ohne Daten zum Fallmanagement: Hier fehlen redundante Felder, die bereits im Fallmanagement-Projekt erfasst werden (Meldungen, Teilnahmeerklärung). Siehe https://github.com/KohlbacherLab/case_management_mvh/

1a. Anlegen des Projekts "Dokumentation mit Daten zum Fallmanagement"

  • Das Projekt inklusive notwendiger Einstellungen kann von einem REDCap Administrator mit der CDISC ODM XML-Vorlage erstellt werden:

Create Project

  • Alternativ kann ein leeres Projekt erstellt werden und dort die Datenstruktur mit der CSV Datei importiert werden (Strichpunkt als Separator).

Die Projekteinstellungen müssen dann allerdings manuell vorgenommen werden, v.a. die Einstellungen zu den wiederholten Fragebögen: Module

1b. Anlegen des Projekts "Dokumentation ohne Daten zum Fallmanagement"

  • Das Projekt inklusive notwendiger Einstellungen kann von einem REDCap Administrator mit der CDISC ODM XML-Vorlage erstellt werden:

Create Project

  • Alternativ kann ein leeres Projekt erstellt werden und dort die Datenstruktur mit der CSV Datei importiert werden (Strichpunkt als Separator).

Die Projekteinstellungen müssen dann allerdings manuell vorgenommen werden, v.a. die Einstellungen zu den wiederholten Fragebögen: Module

2. Aktivieren des Ontologie-Browsers

Zur Eingabe der HPO-Codes etc. muss die Suche in den Ontologien aktiviert werden. Dazu wird der Service im Kontrollcenter -> Modules / Services Configuration aktiviert und ein gültiges Token für die Bioportal API hinterlegt: Ontologie Service

3. Benötigte Module

Zur einfacheren Bedienung werden externe Module eingesetzt. Diese müssen von einem REDCap Administrator im Kontrollzentrum installiert und im Projekt aktiviert werden:

  • Auto Populate Fields: Unterdrückung der Fehlermeldung für versteckte Vorgabe-Werte (@DEFAULT Action Tag)
  • Instance Select: Auswahl einer Instanz eines Formulars
  • Instance Table: Eingabe mehrerer Instanzen eines Formulars
  • Ansicht der im Projekt aktivierten Module: Module

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