diff --git a/Dockerfile b/Dockerfile index 844d428..cd3f49c 100644 --- a/Dockerfile +++ b/Dockerfile @@ -7,26 +7,4 @@ RUN conda config --add channels conda-forge && \ conda config --add channels bioconda && \ conda config --add channels default -RUN conda install python=3 dammit - -RUN mkdir -p /dammit_database && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group metazoa - - -RUN dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group actinobacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group bacillales && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group bacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group bacteroidetes && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group betaproteobacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group clostridia && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group cyanobacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group deltaepsilonsub && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group enterobacteriales && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group firmicutes && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group gammaproteobacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group lactobacillales && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group metazoa && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group proteobacteria && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group rhizobiales && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group spirochaetes && \ - dammit databases --install --database-dir /dammit_database --busco-group tenericutes \ No newline at end of file +RUN conda install python=3 dammit && conda clean -a