istex_metadata_fr.xml

<tool id="istex-metadata" name="Génération d’un fichier de métadonnées" version="0.5.1">
  <description>à partir d’un fichier d’identifiants ISTEX</description>
  <requirements>
    <container type="docker">visatm/istex-metadata</container>
  </requirements>
  <command><![CDATA[
    IstexMetadata.pl -i "$input" -m "$metadata" -l "$language"
    #if $teeft == 'yes'
    -t "$docterm"
    #end if
  ]]></command>
  <inputs>
    <param name="input" type="data" format="txt" label="Fichier d’identifiants ISTEX" />
    <param name="teeft" type="select" display="radio" label="Extraire les descripteurs TEEFT ?">
      <option value="no" selected="true">Non</option>
      <option value="yes">Oui</option>
    </param>
    <param name="language" type="select" display="radio" label="Langue du fichier de métadonnées">
      <option value="en" selected="true">anglais</option>
      <option value="fr">français</option>
    </param>
  </inputs>
  <outputs>
    <data format="tabular" label="Métadonnées de ${on_string}" name="metadata" />
    <data format="tabular" label="“doc × terme” TEEFT de ${on_string}" name="docterm">
      <filter>teeft == 'yes'</filter>
    </data>
  </outputs>

  <tests>
    <test>
      <param name="input" value="istexCorpus.txt" />
      <param name="teeft" value="no" />
      <output name="metadata" file="istexMetadata.txt" />
    </test>
  </tests>

  <help><![CDATA[
À partir de la liste d’identifiants ISTEX id du fichier d’entrée, cet outil va extraire les métadonnées 
correspondantes et produire un fichier **TSV**. 
La première ligne du fichier contient une entête avec le nom des différents champs. 

Il est aussi possible d’extraire les descripteurs TEEFT associés aux mêmes documents pour produire un 
fichier “doc × terme”. 

-----

**Options**

Le programme est appelé avec plusieurs arguments dont un **obligatoire** et les autres *optionnels* 
(en fait, avec des valeurs par défaut).

+ **Nom du fichier d’identifiants ISTEX** 

+ *Extraction des descripteurs TEEFT* (**non** par défaut) 

+ *Langue du fichier de métadonnées*, utilisée pour la liste des noms de champs et la langue de publication (**anglais** par défaut)

-----

**Fichier d’entrée**

Le fichier d’entrée **doit** contenir une ligne avec la mention **ISTEX** entre crochets, 
suivie par une liste d’identifiants, un par ligne, précédé du type de l’identifiant. 
Toute information présente avant l’indication **[ISTEX]** sera ignorée. Chaque identifiant 
peut être suivi d’un symbole dièse ('#') et d’un nom de fichier. 

Exemple :

::

     [ISTEX]
     ark ark:/67375/0T8-VC3W50FL-B             # test001
     ark ark:/67375/6H6-ZNZ982C4-N             # test002
     ark ark:/67375/6H6-4NH81FDN-R             # test003
     ark ark:/67375/6H6-1FSRLFB6-Q             # test004
     ark ark:/67375/WNG-RHR3302C-7             # test005
     ark ark:/67375/WNG-R0P0D6BZ-L             # test006


-----

**Métadonnées**

Le fichier de métadonnées obtenu en sortie est formé de colonnes séparées par des tabulations. 
La première ligne est réservée à l’entête contenant le nom des différents champs :

 + Nom de fichier
 + Titre
 + Auteur
 + Affiliation
 + Source
 + ISSN
 + e-ISSN
 + ISBN
 + e-ISBN
 + Éditeur
 + Type de document
 + Type de contenu
 + Date
 + Langue
 + Résumé
 + Mots-clés d’auteur
 + Catégories WoS
 + Catégories Science-Metrix\t\t
 + Catégories Scopus
 + Catégories INIST
 + Score de qualité
 + Version du PDF
 + Identifiant ISTEX
 + ARK
 + DOI
 + PMID

 ]]></help>

</tool>