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README.Rmd
75 lines (49 loc) · 3.17 KB
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output: github_document
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<!-- README.md is generated from README.Rmd. Please edit that file -->
```{r, include = FALSE}
knitr::opts_chunk$set(
collapse = TRUE,
comment = "#>",
fig.path = "man/figures/README-",
out.width = "100%"
)
```
# <span style="color:#588666">famexploreR</span> <img src="man/figures/logo_famexplorer.png" align="right" width="240"/>
<!-- badges: start -->
[](https://www.repostatus.org/#active)
[](https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0)
[](https://doi.org/10.5281/zenodo.13952463)
<!-- badges: end -->
[famexploreR](https://ajpelu.github.io/famexploreR/) es un flujo de trabajo pensado para facilitar del seguimiento de flora amenazada por parte del personal técnico de la administración, así como la gestión de la información recopilada en campo y la generación de diversos informes a partir de dicha información.
El flujo de trabajo está compuesto por funciones específicas desarrolladas en R y una aplicación desarrollada con shiny. La aplicación permite el cómputo de diferentes variables e índices (riqueza y diversidad vegetal; análisis de vecindad; exploración de rasgos biológicos y reproductivos), así como la visualización espacial de los datos de seguimiento. El formato modular de famexploreR permite incorporar nuevos módulos en función de las necesidades demandadas por los técnicos y gestores encargados de la conservación.
La aplicación permite que técnicos y agentes de medio ambiente, sin necesidad de conocimientos específicos de estadística o programación, puedan generar de manera rápida y sencilla gráficos e informes de los seguimientos de las especies amenazadas, que pueden ser utilizados para planificar actuaciones de gestión.
## Instalación
Puedes instalar la versión de desarrollo de famexploreR desde GitHub con el siguiente código:
``` r
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("ajpelu/famexploreR")
```
**famexploreR** fue construido en [R](https://www.r-project.org), un lenguaje de programación de código abierto, utilizando el paquete [Shiny](https://shiny.rstudio.com), un marco de aplicación web para R.
Puedes descargar la versión de desarrollo de **famexploreR** desde [GitHub](https://github.com/ajpelu/famexploreR).
## Cómo ejecutar famexploreR
La opción recomendada para utilizar la aplicación es descargar el paquete y ejecutarlo localmente.
### Localmente
1. Se recomienda el uso de Rstudio.
2. Descarga e instala el paquete `famexploreR` usando:
``` r
# install.packages("devtools")
devtools::install_github("ajpelu/famexploreR")
```
3. Ejecuta la aplicación:
```r
library("famexploreR")
launch_famexplorer()
```
### Live
También se puede instalar el paquete en un servidor que contenga R-studio y shiny. De forma provisional se muestra un ejemplo [aquí](http://vlab.iecolab.es/ajpelu/famexploreR/)
Todo el código necesario se encuentra en este [repositorio](https://github.com/ajpelu/famexploreR)