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eda_pandas_vs_dplyr.Rmd
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eda_pandas_vs_dplyr.Rmd
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# Pandas vs. dplyr谁是数据分析中最好用的宏包 {#eda-pandas-vs-dplyr}
```{r, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(
echo = TRUE,
warning = FALSE,
message = FALSE,
fig.showtext = TRUE
)
```
本章,我们用一些例子来比较数据科学领域Pandas vs. dplyr 两个宏包的用法
```{r Pandas01, echo=FALSE, eval=FALSE, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(
engine.path = list(python = "F:\\Anaconda3\\python.exe")
)
```
首先,需要加载这个宏包
```{r Pandas02}
library(reticulate)
use_python("F:/Anaconda3/python.exe")
#use_condaenv("Anaconda3", required = TRUE)
#py_config()
```
## 加载数据
这是用 Pandas 方法,
```{python}
import pandas as pd
gapminder = pd.read_csv("./demo_data/gapminder.csv")
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas03}
library(dplyr)
gapminder <- readr::read_csv("./demo_data/gapminder.csv")
```
这个过程,两者没什么区别。再往下看
## 过滤
### 问题1 – 找出2007年的所用记录.
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder[gapminder['year'] == 2007]
```
这是用 dplyr 方法,
```{r Pandas04}
gapminder %>%
filter(year == 2007)
```
### 问题2 – 找出2007年中 continent为 Americas 的记录
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder[(gapminder['year'] == 2007) & (gapminder['continent'] == 'Americas')]
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas05}
gapminder %>%
filter(
year == 2007,
continent == "Americas"
)
```
### 问题3 – 找出2007年中 continent为 Americas,且只包含美国 的记录
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder[(gapminder['year'] == 2007) &
(gapminder['continent'] == 'Americas') &
(gapminder['country'] == 'United States')]
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas06}
gapminder %>%
filter(
year == 2007,
continent == "Americas",
country == "United States"
)
```
## 统计
我们再看看Pandas 和 dplyr 在常用的统计分析方面的表现。
### 问题1 – 计算2007年全球寿命均值
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder[gapminder['year'] == 2007]['lifeExp'].mean()
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas07}
gapminder %>%
filter(year == 2007) %>%
summarize(mean(lifeExp))
```
### 问题2 – 计算2007年每一个洲的寿命均值
这是用 Pandas 方法,
```{python, eval = FALSE}
gapminder[gapminder['year'] == 2007].groupby(by='continent').mean()['lifeExp']
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas08}
gapminder %>%
filter(year == 2007) %>%
group_by(continent) %>%
summarize(mean(lifeExp))
```
### 问题3 – 计算2007年每一个洲的人口总数然后降序输出。
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder[gapminder['year'] == 2007].groupby(by='continent').sum()['pop'].sort_values(ascending=False)
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas09}
gapminder %>%
filter(year == 2007) %>%
group_by(continent) %>%
summarize(total_pop = sum(pop)) %>%
arrange(desc(total_pop))
```
## 创建新变量
### 问题1 – 创建国内生产总值(GDP)变量,即人口数量乘以人均GDP
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder['GDP'] = gapminder['pop'] * gapminder['gdpPercap']
gapminder.head()
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas10}
gapminder %>%
mutate(GDP = pop * gdpPercap)
```
### 问题2 – 人均GDP排名前90%的前十个国家
这是用 Pandas 方法,
```{python}
gapminder_2007 = gapminder[gapminder['year'] == 2007]
gapminder_2007['percentile'] = gapminder_2007['gdpPercap'].rank(pct=True)
gapminder_2007.sort_values(by='percentile', ascending=False)[:10]
```
这是用 dplyr 方法
```{r Pandas11}
gapminder %>%
filter(year == 2007) %>%
mutate(percentile = ntile(gdpPercap, 100)) %>%
arrange(desc(percentile)) %>%
top_n(10, wt = percentile)
```
## 小节
根据以上有限的对比,感觉dplyr语法要简练和清晰些。但是,这并不意味我们一定在Pandas 和 dplyr做取舍,因为解决现实问题,往往取决于我们对工具的熟练程度。以上只是个人观点(哈哈哈)。
## 参考
- <https://appsilon.com/pandas-vs-dplyr/>
- <https://github.com/rstudio/reticulate/issues/863>
- <https://rstudio.github.io/reticulate/articles/python_packages.html>
- <https://github.com/IyarLin/R-advantages-over-python>
- <https://github.com/matloff/R-vs.-Python-for-Data-Science>
```{r Pandas99, echo = F}
# remove the objects
# ls() %>% stringr::str_flatten(collapse = ", ")
#rm(cutoffs, d1, d2, df, mult, std, weights, replace_col_max)
```
```{r Pandas100, echo = F, message = F, warning = F, results = "hide"}
pacman::p_unload(pacman::p_loaded(), character.only = TRUE)
```