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ElsaQr/Taller-de-R

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Taller de R para principiantes

Para estudiantes de Agronomía de la UAM-X y estudiantes de licenciatura en el Instituto de Ecología UNAM

Contenidos

Instalación de R

1. Introducción PARTE I

línea de comando, Grabando tu trabajo, Calculando con R, Almacenamiento con nombre, Funciones, Exacta o aproximada?, R distingue entre mayúsculas y minúsculas, Listado de los objetos en el espacio de trabajo, Vectores, Extrayendo elementos de vectores,

PARTE II

Aritmética vectorial, Vector estampado simple, Valores faltantes y otros valores especiales, Vectores de caracteres, Factores, Matrices y arreglos, Marcos de datos, Datos y tiempos,

2. Entrada y salida de datos

PARTE I

Cambiar directorios, dump() y source(), Redirigir la salida de R,

PARTE II

Guardar y recuperar archivos de imagen, Marcos de datos y la función read.table, Lista,

3. Programación de gráficos estadísticos

Gráfica de barras, Gráficos de puntos, Gráficos circulares, Histogramas, Diagramas de caja, Gráfico de dispersión, QQplot, La región de trazado y los márgenes, Agregar plots, Configuración de parámetros gráficos

4. Programación con R

Control de flujo for() loop, la declaración if (), el bucle while(), El bucle de repetición, Pausa y declaraciones siguientes, Documentación usando #, Reconocer que existe un error, Hacer que el error sea reproducible, Identificar la causa del error, Corregir errores y probar,

5. Temas Especiales

Mario Gutiérrez. Introducción a Redes Booleanas: Morfogénesis Floral en Arabidopsis. Leer Álvarez-Buylla et al. 2008 "Floral morphogenesis: stochastic explorations of a gene network epigenetic landscape" (10.1371/journal.pone.0003626)

Elsa Quezada. Estudio de Secuencias biológicas mediante " MultiDimensional Scaling " . Ejemplo de uso de "MultiDimensional Scaling" en proteinas de plantas https://www.mdpi.com/2223-7747/10/12/2619

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