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JAntonaDiaz/bdfi-practicafinal

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Práctica BDFI: Predicción de retraso de vuelos

Para la realización de la práctica se parte de un dataset que contiene información de vuelos pasados, incluyendo si han salido con retraso o no. A partir de esta información queremos predecir si habrá retrasos en un vuelo futuro. Para ello, entrenamos un modelo predictivo basado en el algoritmo RandomForest con los datos mencionados anteriormente.

Gracias al despliegue de la arquitectura descrita a continuación, utilizaremos el modelo predictivo que hemos creado con el objetivo de realizar predicciones en tiempo real para nuevos vuelos.

Arquitectura Front-end del sistema y versiones

La arquitectura completa del front-end del escenario se muestra a continuación:

Para que el sistema funcione correctamente, se require compatibilidad entre las versiones de los distintos componentes software. Para el despliegue del escenario se han utilizado las siguientes versiones:

  • Máquina virtual con sistema operativo Ubuntu 20.04
  • Intellij (jdk_1.8) *solo usado para el primer hito
  • Pyhton3 (version 3.7)
  • PIP(version 20.0.2)
  • SBT (version 1.8.0)
  • Scala(version 2.12.10)
  • Zookeeper (version 3.6.3)
  • Kafka (version 2.12-3.1.2)
  • MongoDB(version 4.4)
  • Spark (version 3.1.2)

Procesos del sistema

  1. Descargar los datos de vuelos pasados.
  2. Entrenar el modelo de ML con los datos de vuelos usando PySpark.
  3. Desplegar el job de Spark que predice el retraso de los vuelos utilizando el modelo creado.
  4. A través de una interfaz web, el usuario introducirá los datos del vuelo a predecir y se enviarán al servidor web de Flask.
  5. El servidor web enviará esos datos al job a través de Kafka.
  6. El job realizará la predicción y la guardará en Mongo.
  7. La interfaz web estará constantemente haciendo polling para comprobar si ya está realizada la predicción y en caso afirmativo, muestra la predicción por la interfaz web.

Hitos conseguidos

  • Lograr el funcionamiento de la práctica sin realizar modificaciones.
  • Ejecución del job de predicción con Spark Submit en vez de IntelliJ.
  • Dockerizar cada uno de los servicios que componen la arquitectura completa.
  • Desplegar el escenario completo usando docker-compose.
  • Desplegar el escenario completo usando kubernetes.
  • Desplegar el escenario completo en una máquina virtual en Google Cloud accediendo a su interfaz gráfica con el gestor NoMachine.
  • Almacenar y cargar las imágenes de los contenedores en el Container Registry de Google Cloud.

Funcionamiento de la práctica sin realizar modificaciones

Para realizar este hito, se ha utilizado el repositorio utilizado en el enunciado, https://github.com/ging/practica_big_data_2019, y se ha seguido su README.md.

Ejecución del job de predicción con Spark Submit

Cuando se utiliza IntelliJ, se despliega el job desde el IDE sin necesidad de ejecutar ningún comando específico, por lo que toma por defecto las opciones que se necesitarían para ejecutar el programa, siendo innecesario generar ningún paquete con sbt directamente, debido a que el IDE identifica cual es el main class dentro del código fuente.

Por otra parte, spark-submit usa como entorno de ejecución la instancia de spark instalada, ya sea de forma local o remota, y se le debe indicar dónde puede encontrar el fichero empaquetado con sbt, que contendrá el main class. En resumen, la ejecución con IntelliJ solo usa los binarios de spark para ejecutar todo de forma local, mientras que con spark submit se puede usar cualquier instancia de spark para desplegar el código de la aplicación, ya sea de forma local o remota, y así aprovechar las ventajas de distribución de la herramienta.

Partiendo del hito anterior, se va a utilizar sbt, una herramienta de compilación de código abierto para proyectos Scala y Java, similar a Maven.

Para utilizar spark-submit es necesario generar un fichero empaquetado .jar donde se encuentre el main class del código. Este fichero se genera accediendo al directorio bdfi-practicafinal/flight_prediction y ejecutando los siguientes comandos:

sbt clean
sbt package

El fichero .jar estará situado en bdfi-practicafinal/flight_prediction/target/scala-2.12.

Por último, para arrancar la instancia de Spark en local utilizaremos el siguiente comando:

./opt/spark/bin/spark-submit --master local[*] --class es.upm.dit.ging.predictor.MakePrediction --packages org.mongodb.spark:mongo-spark-connector_2.12:3.0.1,org.apache.spark:spark-sql-kafka-0-10_2.12:3.1.2 /home/user1/bdfi-practicafinal/flight_prediction/target/scala-2.12/flight_prediction_2.12-0.1.jar

NOTA: el comando anterior incluye paquetes para que el spark pueda conectarse a Kafka y a Mongo y poder realizar el flujo del sistema.

Despliegue del escenario con DOCKER-COMPOSE

Dockerización de los servicios

Se ha creado un fichero Dockerfile para cada componente del sistema, de manera que se pueda desplegar cada componente en un contenedor distinto. Estos dockerfiles se encuentran en la carpeta bdfi-practicafinal/dockerfile-files de este repositorio. Los contenedores serán desplegados automáticamente con docker-compose, siguiendo las instrucciones que se muestran a continuación.

Despliegue con Docker Compose

En primer lugar, es recomendable eliminar todos los contenedores, redes e imágenes no utilizados. Para ello, se debe ejecutar el siguiente comando:

sudo docker system prune -a

En segundo lugar, hay que clonar el repositorio. Para ello, se debe ejecutar el siguiente comando:

git clone https://github.com/JAntonaDiaz/bdfi-practicafinal.git

En tercer lugar, es necesario acceder al directorio (https://github.com/JAntonaDiaz/bdfi-practicafinal/tree/main/dockerfile-files) mediante la siguiente instrucción:

cd bdfi-practicafinal/dockerfile-files

Finalmente, para desplegar el escenario utilizando docker-compose, es necesario ejecutar el siguiente comando:

sudo docker-compose up

Una vez ejecutado el comando anterior, y todos los contenedores se hayan desplegado y configurado correctamente, se podrá acceder a la interfaz web a través de la siguiente url: http://localhost:5000/flights/delays/predict_kafka. El resulado debe ser muy similar a este: Interfaz web compose

Spark Cluster

Cabe destacar que, puesto que se trata de un escenario distribuido de Big Data, lo lógico es construir un cluster de Spark en el que haya un nodo master que asigne las distintas tareas que se generen a distintos workers.

Es por ello que se han creado dos ficheros Dockerfile, uno que va a cargarlo el máster y otro que va a ser utilizado por los workers. El primer Dockerfile se encarga de crear e iniciar el máster y un worker, mientras que el segundo Dockerfile crea e inicia un solo worker. En este caso, se han añadido dos workers en cotenedores separados adicionales al creado junto al máster.

Para comprobar su correcto funcionamiento, se puede acceder a la url: http://localhost:8080/. El resultado debe ser muy similar a este: Interfaz web spark en compose

Registro de imágenes de los contenedores en el Container Registry de Google Cloud

Aunque no se ha pedido en esta práctica, hemos subido las imágenes de los contenedores al Container Registry de Google Cloud. De esta manera, únicamente es necesario descargarse el docker-compose situado en el directorio bdfi-practicafinal/gcloud de este repositorio. No obstante, para poder utilizarlas, previamente ha sido necesario autenticarse en gcloud mediante el siguiente comando:

gcloud auth login
gcloud init

A continuación, desde el directorio donde se encuentra el fichero Dockerfile que queremos registrar en Google Cloud, hemos ejecutado los siguientes comandos para construir y registrarla:

docker build -t gcr.io/<nombre_proyecto_gcloud>/<nombre_imagen>:<tag> .
docker push gcr.io/<nombre_proyecto_gcloud>/<nombre_imagen>:<tag>

La siguiente figura muestra una captura de pantalla donde aparecen las imágenes que hemos registrado en el Container Registry de Google Cloud.

Container Registry de Google Cloud

Para comprobar su funcionamiento, primero es recomendable (si no se ha hecho anteriormente) eliminar todos los contenedores, redes e imágenes no utilizados. Para ello, se debe ejecutar el siguiente comando:

sudo docker system prune -a

En siguiente lugar, hay que clonar el repositorio. Para ello, se debe ejecutar el siguiente comando:

git clone https://github.com/JAntonaDiaz/bdfi-practicafinal.git

A continuación, es necesario acceder al directorio mediante la siguiente instrucción:

cd bdfi-practicafinal/gcloud

Finalmente, para desplegar el escenario utilizando docker-compose con las imágenes registradas en Google Cloud se debe ejecutar el siguiente comando:

sudo docker-compose up

Una vez ejecutados los comandos anteriores, y todos los contenedores se hayan desplegado y configurado correctamente, se podrá acceder a la interfaz web a través de la siguiente url: http://localhost:5000/flights/delays/predict_kafka.

Despliegue con KUBERNETES

Obtención de los ficheros service.yaml y deployment.yaml

Partiendo del docker-compose.yaml situado en el directorio bdfi-practicafinal/kubernetes y basado en el generado en la sección anterior, se ha utilizado la herramienta Kompose. Esta herramienta permite obtener los archivos necesarios para desplegar el escenario con Kubernetes a partir del docker-compose.

Por ello, una vez instalado Kompose, ejecutando el comando:

kompose convert

en el mismo directorio en el que se encuentra el docker-compose.yaml, generando los disintos x-service.yaml y x-deployment.yaml que hemos agrupado en los ficheros services.yaml y deployment.yaml.

El resultado del comando anterior es el siguiente:

INFO Kubernetes file "flask-server-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "kafka-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "mongo-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "spark-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "worker1-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "worker2-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "zookeeper-service.yaml" created 
INFO Kubernetes file "flask-server-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "kafka-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "mongo-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "spark-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "worker1-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "worker2-deployment.yaml" created 
INFO Kubernetes file "zookeeper-deployment.yaml" created 

No obstante, cabe señalar que los servicios se encuentran configurados como ClusterIP, por lo que desde el exterior no podríamos acceder el servidor Flask. Por ello, es necesario cambiar el tipo de servicio del servidor Flask a NodePort, permitiendo así que al exponer una dirección IP estática externa para el cluster, a través del puerto 30500 podamos acceder al interfaz web. NOTA: el rango de puertos elegibles de tipo NodePort es entre el 30000-32767

Modificación de ficheros del proyecto

Debido a que ya no se despliegan los contenedores en el mismo ordenador, hay que modificar los ficheros que utilizan los distintos componentes para conectarse entre sí ya que por defecto se conectan todos a localhost:puerto_servicio. Los ficheros que deben modificarse son:

  • Para Spark: flight_prediction/src/main/scala/es/upm/dit/predictor/MakePrediction.scala y la construcción del .jar para conectarse a mongo y a kafka.
  • Para Kafka: a través de los scripts bdfi-practicafinal/scripts/startkafka.sh y bdfi-practicafinal/scripts/mod-kafka.py a los que se acceden en la imagen del contenedor, se modificarán los ficheros internos de kafka necesarios para que se conecte con el zookeeper y crear el topic.
  • Para Flask: bdfi-practicafinal/resources/web/predict_flask.py para enviar las entradas del usuario al topic de kafka y conectarse a mongo para poder hacer polling y recibir la predicción. Sin embargo, para poder conectarse, necesitan conocer las direcciones IP interna de los servicios y hasta que no se haga el paso 9 de la siguiente sección no se pueden ver estas direcciones IP. Como solución, se ha optado por pasar las direcciones IP, los puertos y las principales variables de entorno a los contenedores a través de un ConfigMap, el cuál instalaremos en kubernetes tras rellenar las direcciones IP en los pasos 9 y 10 de la siguiente sección.

Despliegue del sistema

  1. Crear un proyecto nuevo en gcloud/Acceder a un proyecto que tengas en gcloud
  2. Abrir la terminal
  3. Acceder a las credenciales del proyecto gcloud config set project project-ID
  4. Establecer la zona horaria donde se va a crear el clúster: gcloud config set compute/zone europe-west2-a
  5. Acceder al directorio bdfi-practicafinal/kubernetes del repositorio donde se encuentran los siguientes ficheros:
    • deployment.yaml
    • configmap.yaml
    • services.yaml
  6. Crear clúster: gcloud container clusters create bdfi-cluster --num-nodes=5 --max-nodes=8 --min-nodes=3
    NOTA: a pesar de tratarse de una práctica y de que valdría con utilizar 2 nodos, hemos decidido que tenga estado dinámico. Para ello, se han definido un número mínimo de nodos, un número máximo y el número de nodos deseados.
  7. Una vez se haya creado el clúster correctamente, acceder a sus credenciales: gcloud container clusters get-credentials bdfi-cluster
  8. Crear los services y la regla del firewall para poder acceder al webserver desde el exterior:
kubectl create -f services.yaml
gcloud compute firewall-rules create allow-webserver --allow=tcp:30500
  1. Acceder a los services creados vía comandos o vía interfaz para obtener las direcciones de los endpoints de los pods que vamos a crear a continuación kubectl get services
  2. Editar el fichero configmap y copiamos las direcciones de kafka, mongo, spark y zookeeper en el configmap.yaml
  3. Meter el configmap en el clúster y crear los pods: kubectl create -f configmap.yaml kubectl create -f deployment.yaml
  4. Esperar a que los contenedores se carguen y ejecuten correctamente.
  5. Acceder a la dirección ip del cluster y establecerla como estática:
    • Menú de navegación > Red de VPC > Direcciones IP externas > CAMBIAR a estática NOTA: Hay tantas direcciones como nodos configurados. Se puede realizar esta acción en cualquiera de ellos, ya que al haber configurado el servicio del servidor flask como NodePort, cada nodo es un proxy de ese puerto hacia el servicio.
  6. Probar el funcionamiento en: ip_estática_externa_cluster:30500/flights/delays/predict_kafka

Lo que se debe obtener es lo siguiente: Interfaz web kubernetes

Además, si modificamos el tipo de servicio del spark master a NodePort y creamos una regla de firewall para poder ver el correcto funcionamiento del Spark cluster y configuramos en ip_estática_externa_cluster:30080 podemos ver lo siguiente: Interfaz web Spark Master

Despliegue del escenario completo en Google Cloud con NoMachine

Para desplegar el escenario completo en Google Cloud, en primer lugar hemos creado a través de la interfaz web de Google Cloud Platform en el mismo proyecto en el que hemos realizado tanto el despliegue de Kubernetes como el registro de las imágenes. Para ello, hay que hacer click en Crear Instancia y la configuramos con una imagen Ubuntu 20.04 con arquitectura x86-64 y 50 GB de almacenamiento. Para correr el escenario completo, es necesario descargarse este repositorio mediante el comando:

git clone https://github.com/JAntonaDiaz/bdfi-practicafinal.git

y seguir cualquiera de las secciones descritas a lo largo de este documento.

Una vez creada la máquina virtual en Google Cloud, hemos descargado y configurado la herramienta NoMachine, con el objetivo de acceder a través de una interfaz gráfica al escritorio de la máquina virtual creada en Google Cloud. NoMachine es un programa informático que realiza conexiones remotas muy rápidas y permite acceder a escritorios remotos en Linux. Para la configuración de esta herramienta, hemos seguido el siguiente tutorial: https://www.nomachine.com/es/acceder-a-su-escritorio-remoto-en-google-cloud-platform-a-trav%C3%A9s-de-nomachine.

Autores

  • José Antonio Antona Díaz
  • Aitor Encinas Alonso

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