Spring analysis

[EmmaCartuyvels1]

Anlysing the SPRING data

[hansvancalster]

Ik had problemen om het bestand lokaal te knitten. Dit had met verschillende zaken te maken:

• het bestand Number of flowers.xlsx is niet mee gepushed
• er is een mix gebruikt van here::here() + optie root.dir om te verwijzen naar bestanden en een nieuw source.Rproj. Je moet ofwel het ene of het andere gebruiken. Ik ben er vanuit gegaan dat je source.Rproj wil gebruiken en heb hiervoor de nodige aanpassingen gemaakt in PR Fix spring analysis #3. In dat geval verwijs je binnen je Rmd naar relatieve paden en specifieer je root.dir niet.
• er zat een fout in _verkenning.Rmd waar werd verwezen naar "optional_functional_group" die niet bestaat. Ik heb dit opgelost in PR Fix spring analysis #3 en ben er daar vanuit gegaan dat alle aparte traits kunnen gecombineerd worden in één trait-profiel zodat de venn diagrammen tonen hoeveel van deze unieke trait combinaties geteld werden (per methode of per maand of combi).

Voor de rest ziet het er goed uit. (maar ik zou het stuk over de flowers graag eens lokaal kunnen runnen om te kunnen beoordelen - daar ontbreekt misschien ook nog wat tekstuele uitleg bij de code). Goed dat de checklist issues van de baan zijn 👍

[hansvancalster]

@EmmaCartuyvels1 kan je nog eens kijken naar de issues van checklist. De checklist action toont dat er nog volgende lintr issues zijn:

--------------------------------------------------------------------------------
5 times "no visible binding for global variable '.data'"
4 times "no visible global function definition for '%>%'"
3 times "no visible global function definition for 'slice_sample'"
2 times "Do not use absolute paths."
1 times "no visible global function definition for 'add_row'"
1 times "no visible global function definition for 'mutate'"
1 times "no visible global function definition for 'tibble'"

Om enkel deze te zien kan je lokaal checklist::check_lintr() uitvoeren.

[hansvancalster]

Ziet er allemaal goed uit 👍