Cours 7 - Présentation interactive sur l'IRM de diffusion avec DIPY

Cours 7 - IRM de diffusion

Cliquez sur le badge ci-dessous et attendez que l'environnement charge complètement. Vous pourrez ensuite accéder au notebook comme si vous aviez un environnement python sur votre machine.

Si la présentation ne se lance pas automatique, vous devrez faire Alt+r.

Installation locale

Si vous désirez rouler le code sur votre machine, assurez-vous d'avoir la liste des packages python (située dans le fichier environment.yml.txt*) installés dans votre environnement local.

Si vous ne savez pas comment, le plus simple est d'installer conda sur votre machine et ensuite cloner le repertoire suivant en cliquer sur le bouton vert en haut à droite [Clone this repo]

Une fois que vous êtes dans le dossier cours7_diffusion et que mini-conda est installé, ouvrez un terminal et écrivez cette commande afin d'installer l'environnement virtuel qui permettra de lancer le jupyter-notebook et la présentation.

conda env create -f environment.yml

Nous ne voulons pas nous attarder aux problèmes d'installation. Pour cela, nous allons éviter les détails d'une installation locale. Par contre, voici un tutoriel <https://neurokit2.readthedocs.io/en/latest/installation.html>_ pour les curieux.ses.