Slurm job manager

Introduction

• 这是什么?

  • 一个用于提交,管理,下载,查询使用slurm系统的超算系统上多账户任务的软件

• 怎么使用?

  • 安装相关的包(见环境配置)之后,从main.py运行
  • 请自行配置server_list.json.(用于储存账户密码,见配置server_list.json)

• 实现了哪些那些功能?

  • 多账户的储存,登录(ssh+scp).
  • 一个简单的(非交互式)命令执行器.
  • 选择本地文件夹,自动上传并提交到slurm系统.
  • 一个任务管理系统,记录提交过的任务的状态,位置等.并可从服务器更新状态.
  • 下载任务到本地.
  • sock5代理支持

Quick start

环境配置

在python3.8下开发.需要额外安装如下包:

• paramiko
• PyQt5
• scp
• PySocks

配置server_list.json

请注意,请务必确保main.py(或main.exe,如果你使用的是release的程序)所在目录有名为server_list.json的文件.否则程序将直接退出.

server_list.json格式如下:

[
  {"server": "server1", "user": "user1", "passwd": "pwd1", "default_dir": "remote1"},
  {"server": "server2", "user": "user2", "passwd": "pwd2", "default_dir": "remote2"}
]

User manual

Notion:请尽量等程序进度条达到100%再进行下一操作.

连接服务器

• 从顶端选框中选中你需要连接的服务器.
• 按下connect按钮

重新连接服务器

• 从顶端选框中选中你需要连接的服务器.
• 按下connect按钮😅

更新任务状态

• 按下Update Jobs Info按钮(不需要先连接服务器).

下载任务

• 选中一个任务(选中该行中任意一格就行).

  指定下载文件

  现在slurm job monitor支持下载指定文件,请在Download files框内输入你需要的文件,支持正则表达式.

  • 默认为*,即下载目录下所有文件.
  • 如果有多个文件,请用空格分开.

  示例

  • 如果你需要下载远程目录下名为pw.relax.out的文件,请在Download files框内输入pw.relax.out.
  • 如果你想下载远程目录下所有后缀名为.out的文件,请在Download files框内输入*.out.
  • 如果你想下载远程目录下所有后缀名为.out和前缀为pw.的文件,请在Download files框内输入*.out pw.*.

• 按下Download Job按钮(不需要先连接服务器),选择目录.

  请不要同时选中多行(后面可能会支持多任务同时下载).

  请不要不选中就按下按钮.

  进度条不会动的,下载完就会变成100%,请耐心等待(大文件下载还是用专业软件吧).*

提交任务

• 确保在您的任务文件夹中有sbatch后缀名的文件,系统会将该文件作为脚本提交.

• 先连接服务器.

• 设置本地任务文件夹和远程目录(远程目录仅支持直接输入绝对地址).

• 按下Submit按钮.

执行指令

• 请不要执行交互式命令(top, etc.)
• 输入指令(右上角的输入框).
• 按下Execute按钮.