ajustes de figuras en reproducibilidad

lisa-coes · Nov 24, 2021 · 3d0975a · 3d0975a
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diff --git a/04b-herramientas.Rmd b/04b-herramientas.Rmd
@@ -21,7 +21,10 @@ Una de las principales cosas que debemos considerar al elaborar un proyecto es s
 
 Teniendo en cuenta lo anterior, la forma en que se encuentran **organizadas** las partes de un proyecto es fundamental para cumplir a cabalidad con lo que se propone cada principio. Como vimos en la sección previa, es posible entender la reproducibilidad como un _espectro_ que involucra una tríada de tres elementos: Datos, Métodos y Resultados.  
 
-[ESQUEMA: Datos - Métodos - Resultados]() 
+```{r scenarios, echo=FALSE, fig.cap="Flujo de trabajo reproducible.", fig.align = 'center', out.width = '75%'}
+knitr::include_graphics(path = "images/flujo-reproducibilidad.PNG")
+```
+
 
 Este esquema es una síntesis que hacemos de algunos de los protocolos más usados en las ciencias sociales. Más que proponer un protocolo nuevo, buscamos describir los elementos fundamentales que contiene una estructura de proyecto reproducible y que están presentes de alguna u otra forma en la mayoría de los protocolos.  
 

diff --git a/docs/04b-herramientas.md b/docs/04b-herramientas.md
@@ -21,7 +21,11 @@ Una de las principales cosas que debemos considerar al elaborar un proyecto es s
 
 Teniendo en cuenta lo anterior, la forma en que se encuentran **organizadas** las partes de un proyecto es fundamental para cumplir a cabalidad con lo que se propone cada principio. Como vimos en la sección previa, es posible entender la reproducibilidad como un _espectro_ que involucra una tríada de tres elementos: Datos, Métodos y Resultados.  
 
-[ESQUEMA: Datos - Métodos - Resultados]() 
+<div class="figure" style="text-align: center">
+<img src="images/flujo-reproducibilidad.PNG" alt="Flujo de trabajo reproducible." width="75%" />
+<p class="caption">(\#fig:scenarios)Flujo de trabajo reproducible.</p>
+</div>
+
 
 Este esquema es una síntesis que hacemos de algunos de los protocolos más usados en las ciencias sociales. Más que proponer un protocolo nuevo, buscamos describir los elementos fundamentales que contiene una estructura de proyecto reproducible y que están presentes de alguna u otra forma en la mayoría de los protocolos.  
 

diff --git a/docs/anexos.html b/docs/anexos.html
diff --git a/docs/análisis-reproducibles.html b/docs/análisis-reproducibles.html
diff --git a/docs/apertura-de-datos.html b/docs/apertura-de-datos.html
diff --git a/docs/conclusión.html b/docs/conclusión.html
diff --git a/docs/consejos-para-la-apertura-de-datos-de-investigación-social.html b/docs/consejos-para-la-apertura-de-datos-de-investigación-social.html
diff --git a/docs/cuál-es-el-destino-de-las-ciencias-sociales-en-el-mundo-del-open-access.html b/docs/cuál-es-el-destino-de-las-ciencias-sociales-en-el-mundo-del-open-access.html
diff --git a/docs/cómo.html b/docs/cómo.html
diff --git a/docs/diseño-transparente.html b/docs/diseño-transparente.html
diff --git a/docs/estándares-y-experiencias-internacionales.html b/docs/estándares-y-experiencias-internacionales.html
diff --git a/docs/formas-open-access.html b/docs/formas-open-access.html
diff --git a/docs/herramientas-para-los-análisis-reproducibles.html b/docs/herramientas-para-los-análisis-reproducibles.html
diff --git a/docs/herramientas-para-los-diseños-transparentes.html b/docs/herramientas-para-los-diseños-transparentes.html
diff --git a/docs/herramientas-para-publicar.html b/docs/herramientas-para-publicar.html
diff --git a/docs/images/flujo-reproducibilidad.PNG b/docs/images/flujo-reproducibilidad.PNG
diff --git a/docs/index.html b/docs/index.html
diff --git a/docs/index.md b/docs/index.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 title: "Ciencia Social Abierta"
 # subtitle: "<center>Documento de trabajo</center>"
 # author: "Investigador a cargo: Juan Carlos Castillo <br> Asistente de investigación: Valentina Andrade <br> Pasante: Vanessa Leyton"
-date: "18 octubre 2021"
+date: "24 noviembre 2021"
 site: bookdown::bookdown_site
 documentclass: book
 bibliography: [book.bib, packages.bib, input/bib/lisacoes.bib]

diff --git a/docs/introducción.html b/docs/introducción.html
diff --git a/docs/libs/gitbook-2.6.7/css/plugin-bookdown.css b/docs/libs/gitbook-2.6.7/css/plugin-bookdown.css
@@ -97,9 +97,3 @@ div.proof>*:last-child:after {
 .header-section-number {
   padding-right: .5em;
 }
-#header .multi-author {
-  margin: 0.5em 0 -0.5em 0;
-}
-#header .date {
-  margin-top: 1.5em;
-}
diff --git a/docs/libs/gitbook-2.6.7/js/plugin-search.js b/docs/libs/gitbook-2.6.7/js/plugin-search.js
@@ -1,24 +1,9 @@
 gitbook.require(["gitbook", "lodash", "jQuery"], function(gitbook, _, $) {
     var index = null;
-    var fuse = null;
-    var _search = {engine: 'lunr', opts: {}};
     var $searchInput, $searchLabel, $searchForm;
     var $highlighted = [], hi, hiOpts = { className: 'search-highlight' };
     var collapse = false, toc_visible = [];
 
-    function init(config) {
-        // Instantiate search settings
-        _search = gitbook.storage.get("search", {
-            engine: config.search.engine || 'lunr',
-            opts: config.search.options || {},
-        });
-    };
-
-    // Save current search settings
-    function saveSearchSettings() {
-        gitbook.storage.set("search", _search);
-    }
-
     // Use a specific index
     function loadIndex(data) {
         // [Yihui] In bookdown, I use a character matrix to store the chapter
@@ -29,36 +14,18 @@ gitbook.require(["gitbook", "lodash", "jQuery"], function(gitbook, _, $) {
         // lunr cannot handle non-English text very well, e.g. the default
         // tokenizer cannot deal with Chinese text, so we may want to replace
         // lunr with a dumb simple text matching approach.
-        if (_search.engine === 'lunr') {
-          index = lunr(function () {
-            this.ref('url');
-            this.field('title', { boost: 10 });
-            this.field('body');
-          });
-          data.map(function(item) {
-            index.add({
-              url: item[0],
-              title: item[1],
-              body: item[2]
-            });
+        index = lunr(function () {
+          this.ref('url');
+          this.field('title', { boost: 10 });
+          this.field('body');
+        });
+        data.map(function(item) {
+          index.add({
+            url: item[0],
+            title: item[1],
+            body: item[2]
           });
-          return;
-        }
-        fuse = new Fuse(data.map((_data => {
-            return {
-                url: _data[0],
-                title: _data[1],
-                body: _data[2]
-            };
-        })), Object.assign(
-            {
-                includeScore: true,
-                threshold: 0.1,
-                ignoreLocation: true,
-                keys: ["title", "body"]
-            },
-            _search.opts
-        ));
+        });
     }
 
     // Fetch the search index
@@ -69,33 +36,20 @@ gitbook.require(["gitbook", "lodash", "jQuery"], function(gitbook, _, $) {
 
     // Search for a term and return results
     function search(q) {
-        let results = [];
-        switch (_search.engine) {
-            case 'fuse':
-                if (!fuse) return;
-                results = fuse.search(q).map(function(result) {
-                    var parts = result.item.url.split('#');
-                    return {
-                        path: parts[0],
-                        hash: parts[1]
-                    };
-                });
-                break;
-            case 'lunr':
-            default:
-                if (!index) return;
-                results = _.chain(index.search(q)).map(function(result) {
-                    var parts = result.ref.split("#");
-                    return {
-                        path: parts[0],
-                        hash: parts[1]
-                    };
-                })
-                .value();
-        }
+        if (!index) return;
+
+        var results = _.chain(index.search(q))
+        .map(function(result) {
+            var parts = result.ref.split("#");
+            return {
+                path: parts[0],
+                hash: parts[1]
+            };
+        })
+        .value();
 
         // [Yihui] Highlight the search keyword on current page
-        $highlighted = $('.page-inner')
+        $highlighted = results.length === 0 ? [] : $('.page-inner')
           .unhighlight(hiOpts).highlight(q, hiOpts).find('span.search-highlight');
         scrollToHighlighted(0);
 
@@ -218,7 +172,6 @@ gitbook.require(["gitbook", "lodash", "jQuery"], function(gitbook, _, $) {
     gitbook.events.bind("start", function(e, config) {
         // [Yihui] disable search
         if (config.search === false) return;
-        init(config);
         collapse = !config.toc || config.toc.collapse === 'section' ||
           config.toc.collapse === 'subsection';